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AI正在重構藥物臨床試驗流程,蘋果正在打通數(shù)據(jù)重構臨床試驗

2018-08-17 14:03
動脈網(wǎng)
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測試新藥是一個緩慢、昂貴和耗費人力的過程。人工智能有可能重構臨床試驗過程的每個階段——無論是從匹配符合條件的患者到臨床試驗過程,再到監(jiān)測依從性和數(shù)據(jù)收集。

 在美國,2018年有超過170萬人首次被診斷出患有癌癥。與此同時,超過1萬項臨床試驗將各自需要招募數(shù)千名新患者,用于測試可能拯救生命的實驗性癌癥藥物。然而,只有不到5%的癌癥患者最終參加了試驗。

 造成臨床試驗無法匹配合適的患者原因是多重的。對于癌癥這樣的絕癥,只有當現(xiàn)有的治療方法已經(jīng)失敗時,患者才可以參加藥物試驗。最重要的是,并不是所有被診斷出患有絕癥的病人都有資格參臨床試驗,甚至,發(fā)現(xiàn)他們是否有資格參加就是一項艱巨的任務。 

對于那些有資格參加試驗的人來說,參加試驗需要大量的成本和時間,而現(xiàn)有的數(shù)據(jù)收集方法把這一過程變得更加復雜。

 現(xiàn)有臨床試驗的過程也不止是讓患者日子難過,臨床試驗對于的其它利益相關方例如藥企、CRO而言也是一個低效的過程。藥物試驗平均耗時近十年,耗資高達數(shù)十億美元。許多試驗由于注冊問題而失敗。這些都在說明這個價值650億美元的臨床試驗市場需要進行改造。 

人工智能現(xiàn)在被吹捧為萬能的靈丹妙藥,該技術在簡化冗雜臨床試驗過程方面具有巨大潛力。例如從遠程監(jiān)測的物聯(lián)網(wǎng)到處理EHR數(shù)據(jù)的機器學習,再到基于人工智能的數(shù)據(jù)保護網(wǎng)絡安全。

 美國知名數(shù)據(jù)服務機構CBinsight近期分析了人工智能在臨床試驗中的前景和局限性,動脈網(wǎng)對此作了整理編譯。 

本文主要內(nèi)容包括:

1.為什么制藥公司需要加快藥品研發(fā)過程?

臨床試驗現(xiàn)狀

2.AI如何改變臨床試驗環(huán)節(jié)?

患者招募上匹配病人和試驗

簡化注冊流程

數(shù)據(jù)收集和依附性上

3.蘋果公司準備如何重構臨床試驗

4.為什么只有AI不能成為靈丹妙藥 

為什么制藥公司需要加快藥物研發(fā)過程

新藥上市是一個漫長而艱巨的過程。

 盡管沒有藥物研發(fā)相關支出和時間表的中央存儲庫,但研究估計,新藥在患者身上進行測試的時間平均耗時7.5年,每一種藥物的成本在1.61億至20億美元之間。

 眾所周知,臨床試驗需要多階段進行,而且在這個過程中,成本和花費是遞增的。三期試驗需要更多的患者群體,而且比一期試驗昂貴和復雜得多。就算已經(jīng)投入了大量的時間和金錢,但是最后,所有進行了一期臨床試驗的新藥,只有十分之一會被FDA批準上市。 

臨床試驗失敗的原因有很多,包括未能招募到足夠的參與者、中途病人退出、意外和嚴重的副作用以及數(shù)據(jù)收集方法不當都可能導致新藥夭折。

 當然,越是在后期失敗的臨床試驗,臨床試驗發(fā)起者和患者越要付出更高的代價。有時候臨床試驗失敗帶來的打擊對制藥公司來說很可能是致命的。

 例如,瑞士諾華將其17年第一季度凈收益下降15%歸因于一種用于治療心力衰竭的III期藥物的失敗。這還不算什么,在美國,制藥公司Tenax Therapeutics的主要藥物在第三階段試驗失敗兩個月后,CEO引咎辭職。據(jù)報道,該公司正考慮合并或出售。 

對于進入這一領域的小型生物制藥和初創(chuàng)企業(yè)藥企來說,失敗的代價更為顯著。失敗的風險是絕對的,特別是制藥公司只押寶在一種藥物上。

 與藥物研發(fā)相關的高成本最終只會轉(zhuǎn)嫁到消費者身上。消費者購買的醫(yī)療保健服務不僅包括了成功研發(fā)藥物的成本,他們同樣需要為那些失敗了的臨床試驗買單。這也是為什么藥價如此之高。

 除去經(jīng)濟代價,失敗或無效試驗的人為代價是病人。

對大多數(shù)患者來說,發(fā)現(xiàn)臨床試驗是一個嘗試的過程,但是注冊和參與卻帶來了新的挑戰(zhàn)。

 許多臨床研究仍然使用原始的和過時的方法來收集和驗證數(shù)據(jù),通過傳真發(fā)送病人的醫(yī)療記錄,手工清點瓶子里剩余的藥片,以及依靠病人日記記錄來確定服藥依從性。顯然這個過程需要被重構。

AI將如何改變臨床試驗環(huán)節(jié)

可以說AI擁有改變臨床試驗中的每一個環(huán)節(jié)的能力,從臨床試驗注冊到病人依從性管理。

發(fā)現(xiàn)臨床試驗

 改變現(xiàn)有的臨床試驗過程,將合適的患者同需要的臨床試驗匹配能夠節(jié)約大量的時間,無論是對于患者還是對于制藥公司。

 根據(jù)Cognizant關于招募預測的一份報告,大約80%的臨床試驗未能在期限內(nèi)招募到合適的患者,大約有三分之一的III期臨床研究由于患者招募困難而終止。

 目前,美國有超過1.8萬項臨床研究正在招募患者,其中僅乳腺癌一項就有約1000項。CBinsight援引白宮的在2018年5月的說法:“實際上,只有3%的癌癥病人能夠參與到臨床試驗中! 

如果醫(yī)生知道正在進行的試驗,患者可能偶爾會從醫(yī)生那里得到試驗建議。否則,患者就需要自己從政府部門ClinicalTrials.Gov中尋找相關信息。ClinicalTrials.Gov是一個全面的聯(lián)邦數(shù)據(jù)庫,收集了過去和正在進行的臨床試驗信息。

 假如有AI,理想的方案是使用人工智能軟件,從病人的病歷中提取相關信息,與正在進行的試驗進行比較,并建議進行匹配研究。

 事實上,從醫(yī)療記錄中提取信息——包括EHRs和實驗室圖像——是人工智能在醫(yī)療領域最受歡迎的應用之一。然而,這項技術的真正落地不得不面臨一些挑戰(zhàn),比如非結構化醫(yī)療數(shù)據(jù)和互不通信的不同數(shù)據(jù)源。 

EHR互操作性的挑戰(zhàn)

盡管聯(lián)邦政府在過去十年中花費了超過280億美元來推行數(shù)字化電子健康記錄(EHRs),但是對于病人的醫(yī)療數(shù)據(jù),并沒有一個集中的存儲庫或標準格式。事實上,病人很難從他去過的所有醫(yī)療機構中集成所有的醫(yī)療信息。 

HIPAA法案是一項保護患者醫(yī)療數(shù)據(jù)和隱私的法律,它允許將患者數(shù)據(jù)與姓名和SSN號碼等可識別個人身份的信息共享,這種共享一般基于患者簽署知情同意書后。這使得人工智能初創(chuàng)公司能夠在幾分鐘內(nèi)分析這些醫(yī)療數(shù)據(jù),并建議符合條件的患者,按照目前的流程,這個過程將需要幾個月的時間。 

但是互操作性(兼容)的問題依然存在,跨機構或者不同軟件之間無法輕松共享健康信息。

 治療同一病人的不同醫(yī)院可能會使用不同的EHR軟件來輸入數(shù)據(jù)。在臨床試驗中,研究人員仍會向不同的醫(yī)院發(fā)送具體病人記錄的傳真請求,這些醫(yī)院隨后會以圖片(包括手寫筆記或PDF文件的圖片)的形式將信息傳真或發(fā)送電子郵件。

 這對人工智能技術提出了挑戰(zhàn)。麻省理工學院、哈佛大學、約翰霍普金斯大學和紐約大學的研究人員的一項研究表明:“在臨床注釋中,情緒分析和詞義消歧等標準的自然語言處理任務是很困難的,因為臨床數(shù)據(jù)常常出現(xiàn)拼寫錯誤、首字母縮寫和大量復制粘貼! 

健康人工智能公司Flatiron Health在一份專利申請中進一步解釋了這一點:“結構化數(shù)據(jù)也可能因為傳輸方式而變得非結構化。例如,電子表格傳真或轉(zhuǎn)換成只讀文檔(比如PDF)會丟失其大部分結構。

 這種過時的人工系統(tǒng)使得臨床試驗研究人員難以收集確定患者資格所需的準確數(shù)據(jù)。

 去年,總部位于加州的創(chuàng)業(yè)公司Mendel的AI試圖通過整合癌癥患者病史的方式來解決這一挑戰(zhàn),患者可以在Mendel的平臺上提交自己的病歷。或者,病人可以允許Mendel代表他們從醫(yī)生那里收集所有的醫(yī)療記錄。

 Mendel正在開發(fā)機器學習算法,從數(shù)字記錄中提取信息,并將病人與正在進行的最適合他們需要的試驗相匹配。這家初創(chuàng)公司以訂閱的方式向患者收取費用,最初3個月以99美元的起價處理所有醫(yī)療記錄數(shù)據(jù)。

 但Mendel從那以后沒有宣布進一步的擴展計劃,也沒有進一步籌集資金。此外,其網(wǎng)站上的上傳醫(yī)療記錄的選項已不再可用。

 其他公司,如 Antidote.me正在使用機器學習來簡化ClinicalTrials.Gov網(wǎng)站上列出的“納入/排除”標準中的術語。

 在B2B方面,創(chuàng)業(yè)公司正在使用深度學習和自然語言處理,通過直接與健康機構合作,使臨床試驗匹配自動化。例如,Deep 6 AI與Cedars-Sinai醫(yī)療中心以及TD2合作。TD2是一家腫瘤CRO公司。 

收購成為解決互操性的策略

Flatiron Health在2014年收購了一家關注腫瘤的EMR公司Altos Solutions,解決了互操作性問題。

當時,F(xiàn)latiron正將其云分析平臺出售給醫(yī)療和生命科學公司。Altos的EMR也被 Florida Cancer Specialists腫瘤學機構使用。該交易讓Flatiron能夠直接訪問患者的原始數(shù)據(jù),而不是僅僅依賴第三方電子郵件。

 截至目前,超過2500名臨床醫(yī)生使用Flatiron 's OncoEMR,相關報道表示有超過200萬活躍的病人記錄可供研究。 

此外,羅氏于2018年2月以19億美元收購了Flatiron。這成為在人工智能領域最大的并購交易之一。這一點,再加上羅氏近期收購Foundation Medicine和Viewics等其他數(shù)字化舉措,突顯出羅氏有意將自己重新定位為一家由機器學習驅(qū)動、高度關注數(shù)據(jù)的制藥公司。

臨床試驗注冊的挑戰(zhàn) 

當病人發(fā)現(xiàn)合適的臨床試驗時,登記程序不會結束。相反,患者必須訪問參與試驗的地點,確認他是否有資格,患者還需與臨床研究小組的研究人員進行初步電話篩選。患者也必須滿足試驗列表中的納入和排除標準,每個病人都必須滿足一個研究的資格。而這些標準常常充斥著醫(yī)學術語。

 例如在FDA批準的一項關于乳腺癌的臨床試驗中,患者必須通過評估,如實驗室和成像測試,以確保她符合所有的納入和排除標準。 

根據(jù)他們的可用性和他們離試驗地點的距離,一些病人可以在不到一周的時間內(nèi)完成這些程序。但對于那些忙于工作、父母或長時間通勤的人來說,這個過程可能需要多次出差。 

作為確認資格的一部分,現(xiàn)場調(diào)查人員從其他醫(yī)生辦公室收集病人的醫(yī)療記錄。如前所述,這些傳真或電子郵件副本在使用人工智能提取信息時增加了一層復雜性。

 如果符合條件,患者簽署同意臨床試驗條款的同意書。這包括意識到潛在的副作用,愿意提供含有遺傳信息的生物樣本,以及支付研究預算中未包括的費用。

 一些使用人工智能從病人病歷中提取信息的解決方案可以通過自動驗證某些納入和排除標準來幫助簡化注冊過程。

 更有效的解決方案是使用病人生成的數(shù)據(jù)。由于實時生成的數(shù)據(jù)量很大,AI與患者生成的數(shù)據(jù)是不可分割的。蘋果公司正在探索這方面的應用。

 Apple正在圍繞iPhone和Apple Watch逐步建立一個臨床研究生態(tài)系統(tǒng)。通過在舒適的家中對病人進行持續(xù)監(jiān)測,該公司可以產(chǎn)生大量以前無法獲得的健康數(shù)據(jù)。

蘋果公司已經(jīng)在與醫(yī)療機構和醫(yī)學研究人員合作,以輕松地確定適合他們研究的患者群體。下面將具體探討這一部分。

臨床試驗病人依從性

在病人確認參加臨床試驗后。病人回家后,會帶著第一個療程的藥物(例如,一個30天的藥瓶,說明劑量)和需要每天填寫的病人日記。許多臨床研究仍然使用紙質(zhì)日記而不是電子系統(tǒng)。

 患者在服用研究藥物時,需要注意當時服用的其他藥物,以及任何不良反應(包括頭痛、胃痛、肌肉疼痛)。

 從中可以發(fā)現(xiàn)整個臨床試驗數(shù)據(jù)的記錄依賴于無法證實的信息來源,比如病人的記憶和紙質(zhì)記錄,會導致效率低下。

 對病人記憶的依賴:當病人來做定期檢查時,研究人員檢查他們的藥瓶,以確保沒有剩余的藥片,并檢查病人的日記中是否有空白或不一致的地方。如果日記條目中缺少信息,研究者就依賴于患者對事件的記憶。這使得這個過程容易出現(xiàn)人為錯誤。

 過時的記錄系統(tǒng):紙質(zhì)文件可能會丟失信息,這是一種過時和不可靠的方式,它記錄的關鍵信息可能被丟失。

 病人放棄風險:頻繁前往臨床研究地點進行定期檢查會對患者造成時間和金錢的壓力,尤其是對于那些在國外旅行的患者(機票、酒店住宿、休假時間等)。這加大了病人中止的風險。 

額外費用:雖然患者簽署的同意書中包含了自付費用,但很多患者不明白可能會有額外費用。例如,在隨訪期間進行的額外MRI和實驗室檢查可能不包括在試驗中,而且保險公司也不會覆蓋這些費用,因為它們是用于“研究”目的,而不是出于“醫(yī)療需要”。

AI如何幫助藥物治療和提高依從性

不堅持治療,或者不以正確的方式服用藥物,可能會對病人的健康產(chǎn)生不利影響,對于研究方來說,如果一項研究招募新病人,就會增加成本,并影響研究結果的準確性。

 臨床研究的發(fā)起者們迫切希望改變這一狀況,并為此投資技術。

 除了使用移動技術提醒患者服藥外,輝瑞和諾華制藥公司還在物聯(lián)網(wǎng)和“可吸收傳感器”方面進行投資,以跟蹤藥物攝入情況。在17年第一季度,默克風險投資公司(Merck Ventures)參與了Medisafe公司1450萬美元的B輪融資,該公司開發(fā)無線藥瓶。

 人工智能初創(chuàng)企業(yè)在病人依從性上走得很遠,提供了視覺確認方案?偛课挥诩~約的移動SaaS平臺AiCure使用圖像和面部識別算法來跟蹤病人依從度;颊哂檬謾C錄下自己吞下藥片的視頻,AiCure確認是正確的人吃了正確的藥片。在國家健康研究所和國家藥物濫用研究所等機構的一系列資助之后,AiCure又籌集了2700萬美元的新一輪融資。

 這個領域的另一家初創(chuàng)公司,由Khosla Venture支持的Catalia Health正在開發(fā)一款使用人工智能的醫(yī)療伴侶和顧問。 

Catalia希望通過詢問特定的問題,設置提醒,以及為每個患者量身定制對話來加強患者的行為改變。該公司的目標之一是了解為什么病人依從性差。Catalia的機器人助手本質(zhì)上是一款帶有觸摸屏的平板電腦,但據(jù)報道,這家初創(chuàng)公司也在致力于語音激活。

 值得注意的是,人工智能助手成功改變生活方式的能力在很大程度上取決于患者是否愿意每天與人工智能進行互動——這一點可以通過人工智能物聯(lián)網(wǎng)技術進行監(jiān)控。 

AI+物聯(lián)網(wǎng)提供持續(xù)的每日反饋

一個新興的趨勢是將生物傳感器與人工智能融合在一起。

 為此,一些初創(chuàng)公司正在開發(fā)自己的監(jiān)控設備和傳感器,然后添加一層機器學習來解釋數(shù)據(jù)。其他人則只在開發(fā)人工智能軟件,并與第三方家庭監(jiān)控設備進行整合。 

以色列公司ContinUse Biometrics 正在開發(fā)自己的傳感技術。這家初創(chuàng)公司監(jiān)測了20多個生物參數(shù)——包括心率、血糖水平和血壓,這是藥物試驗期間測量的一些標準生命特征——并使用人工智能來發(fā)現(xiàn)異常行為。該公司在2018年第一季度B輪融資中融資2000萬美元。 

Biofourmis正在開發(fā)一個人工智能分析引擎,它從FDA批準的家庭監(jiān)測設備中提取數(shù)據(jù)并預測患者的健康結果。

 AI +物聯(lián)網(wǎng)在臨床試驗中具有實時、持續(xù)監(jiān)測患者生理和行為變化的潛力,有可能降低現(xiàn)場檢查的成本、頻率和難度。

蘋果準備如何重構臨床試驗

對于小型初創(chuàng)企業(yè)來說,簡化臨床試驗的最大障礙是這些技術相對較新,且行業(yè)適應速度較慢。

 不過,蘋果(Apple)等科技巨頭已經(jīng)看到,它們在吸引合作伙伴參與其關注醫(yī)療保健的舉措方面取得了成功。蘋果(Apple)已經(jīng)在解決醫(yī)療行業(yè)信息流中的一些瓶頸,允許研究人員使用其API構建人工智能應用。 

特別是,蘋果正在圍繞其兩款設備iPhone和Apple Watch建立一個臨床研究生態(tài)系統(tǒng)。數(shù)據(jù)是人工智能應用的核心。通過這些產(chǎn)品,蘋果公司可以向醫(yī)學研究人員提供兩種數(shù)據(jù)流,這兩種數(shù)據(jù)在目前都難以獲得。

蘋果的大數(shù)據(jù)流

 自2015年以來,蘋果推出了兩個開源框架——ResearchKit和CareKit——以幫助臨床試驗招募患者并遠程監(jiān)控他們的健康狀況。這些框架允許研究人員和開發(fā)人員創(chuàng)建醫(yī)療應用程序來監(jiān)控患者的日常生活。

 例如,杜克大學(Duke University)的研究人員開發(fā)了一款名為“自閉癥與超越”(Autism & Beyond)的應用程序,它使用iPhone的前置攝像頭和面部識別算法對兒童進行自閉癥篩查。

 與此類似,近1萬人使用了mPower應用程序,該應用程序在用戶知情同意情況下,使用手指敲擊和步態(tài)分析等練習來研究帕金森疾病。該應用的其他變體,比如面向Android用戶的HopkinsPD,使用機器學習來處理從智能手機中收集的數(shù)據(jù),從而評價患者帕金森病情的嚴重程度。 

重構EHR數(shù)據(jù)共享

 今年1月,蘋果(Apple)宣布,iPhone用戶現(xiàn)在可以通過iPhone的健康APP訪問他們所有的醫(yī)療記錄信息。這一功能被稱為“健康記錄”API,是人工智能醫(yī)療初創(chuàng)公司Gliimpse在2016年被蘋果收購之前所做的工作的延伸。

 Gliimpse網(wǎng)站上的信息顯示,它的“核心技術是將醫(yī)療文檔轉(zhuǎn)化為數(shù)據(jù),方便地搜索和過濾最重要的圖形和儀表板”。這與蘋果公司開發(fā)的健康記錄功能相一致——一個易于使用的界面,用戶可以找到他們需要的過敏、疾病、免疫、實驗室結果、藥物、程序和生命體征信息。

 蘋果還與Cerner和Epic等熱門的EHR供應商合作,解決互操作性問題。這些合作關系的一個潛在最終目標可能是雙向數(shù)據(jù)流,在這種情況下,EHR供應商被鼓勵將患者生成的數(shù)據(jù)集成到蘋果軟件中。

 來自蘋果公司的發(fā)言稱:“500多名醫(yī)生和醫(yī)學研究人員使用蘋果的ResearchKit和CareKit軟件工具進行臨床研究,涉及300萬參與者,涉及的疾病從自閉癥和帕金森癥到外科手術后的家庭康復和物理治療。” 

今年6月,蘋果為開發(fā)者推出了健康記錄API。用戶可以選擇與第三方應用程序或醫(yī)學研究人員共享他們的數(shù)據(jù)。此舉為疾病管理和生活方式監(jiān)測開辟了新的可能性。

這些數(shù)據(jù)對臨床研究意味著什么? 

蘋果現(xiàn)在正處于一個新的醫(yī)療數(shù)據(jù)生態(tài)系統(tǒng)的中心,提供以前無法獲得的健康數(shù)據(jù),同時收集難以整合的EHR信息。

 在使用人工智能和機器學習進行早期診斷、推動藥物設計決策、招募合適的患者進行研究、以及在整個研究過程中遠程監(jiān)控患者的進展方面,應用場景將是無窮無盡。

 蘋果在這個領域的一個潛在競爭對手是谷歌。谷歌的 Project Baseline計劃旨在招募1萬名患者,并在5年的時間里監(jiān)控他們的日常生活,最終可能造福于臨床試驗。

 許多試驗有實驗組(服用研究藥物的病人)和對照組(服用安慰劑的病人)。對照組的目的是建立一個基線來與實驗組的癥狀進行比較。病人通常不知道自己在服用什么藥物。

 患者生成的數(shù)據(jù)——就像谷歌的 Project Baseline正在收集的一樣——可以消除對控制組的需求,提供控制所需的數(shù)據(jù),并最終減少患者招募困難。然而,該項目仍處于早期階段,具體應用可能要過幾年才能實現(xiàn)。 

為什么只有AI不是萬能的

醫(yī)療保健行業(yè)在人工智能應用方面處于領先地位,試驗了從機器輔助診斷到從電子健康記錄中提取信息的應用。

 尤其值得一提的是,利用AI發(fā)現(xiàn)新藥也呈增長勢頭,制藥巨頭默克公司(Merck)與初創(chuàng)公司Atomwise合作,葛蘭素史克(GlaxoSmithKline)與Insilico Medicine等公司合作,將AI應用到新藥研發(fā)上。

 但人工智能在實際臨床試驗過程中的應用仍處于初級階段。

 與醫(yī)療保健的其他領域相比,直接針對臨床試驗領域客戶的初創(chuàng)企業(yè)更少。在臨床試驗的許多方面,AI的落地,首先需要整個行業(yè)的數(shù)字化。

 如上所述,許多試驗仍然依賴于紙質(zhì)日記來獲取數(shù)據(jù)。哪怕有些部分以數(shù)字格式儲存,也難以搜索。而手寫的臨床記錄在提取信息上必須克服處理自然語言處理這一挑戰(zhàn)。

 在臨床試驗中,最大的障礙之一將是克服惰性,徹底更新目前不再有效的流程。

 另一個挑戰(zhàn)將是準確理解人工智能可以在哪里提供幫助以及它目前的局限性。研究人員必須圍繞可實現(xiàn)的短期目標展開討論,而不是幻想AI讓所有問題都消失。 

就目前而言,開發(fā)新的數(shù)據(jù)來源并將數(shù)據(jù)交給患者——就像蘋果公司正在做的那樣——在臨床研究中被證明是革命性的,一個絕佳的例子就是利用APP互動為患者的帕金森嚴重程度評分。

 最終,人工智能應用于臨床試驗的目標,將是縮小患者目前可獲得的信息與他們真正需要的信息的差距,讓他們過上更健康的生活。

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