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國內(nèi)腫瘤學(xué)論文入選AACR會刊,3D卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)助力早期腫瘤浸潤研究

近日獲悉,點(diǎn)內(nèi)科技、復(fù)旦大學(xué)附屬華東醫(yī)院“張國楨肺微小結(jié)節(jié)診治中心”和上海交通大學(xué)“SJTU-UCLA機(jī)器感知與推理聯(lián)合研究中心”組成聯(lián)合研究團(tuán)隊的共同合作科研成果“3D Deep Learning from CT Scans Predicts Tumor Invasiveness of Subcentimeter Pulmonary Adenocarcinomas ”發(fā)表于美國癌癥研究協(xié)會(American Association for Cancer Research,AACR)會刊《Cancer Research》,這一雜志在2017年的影響因子為9.13。

論文截圖

該文章與2018年10月2日在線發(fā)表,文章利用深度學(xué)習(xí)的方法對像素級標(biāo)注的亞厘米肺腺癌CT數(shù)據(jù)和其病例結(jié)果標(biāo)注進(jìn)行訓(xùn)練,通過多任務(wù)的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對亞厘米肺腺癌的浸潤風(fēng)險程度進(jìn)行自動術(shù)前預(yù)測,并建立醫(yī)療影像上的任務(wù)譜降低模型的學(xué)習(xí)難度,遷移泛化能力、穩(wěn)定性和可靠性。該研究能幫助醫(yī)生選擇早期肺癌的治療方法,將有效推動精準(zhǔn)醫(yī)療發(fā)展。

CT影像預(yù)測早期腫瘤病例浸潤,精確解決肺癌篩查難題

復(fù)旦大學(xué)華東醫(yī)院李銘教授談到了肺癌的現(xiàn)狀:“我國屬于肺癌高發(fā)國家,5年生存率低于20%,死亡率在所有癌癥中位列第一的位置。其原因來源于國內(nèi)的患者缺乏早篩意識,患者發(fā)現(xiàn)肺癌時往往已是中晚期,以現(xiàn)在的醫(yī)療水平治療乏力。同時,高昂的醫(yī)療費(fèi)用不僅讓患者家庭入不敷出,相應(yīng)的醫(yī)療保險也為國家?guī)砹司薮蟮呢?fù)擔(dān)。所以,我國已經(jīng)發(fā)布多個政策試圖將患者下放至基層,這個過程需要人工智能進(jìn)行輔助。”

然而,國內(nèi)肺結(jié)節(jié)公司眾多,雖圖像識別的準(zhǔn)確率相差無幾,但整個診斷流程良莠不齊。為在整個產(chǎn)業(yè)中脫穎而出,點(diǎn)內(nèi)科技嘗試用多分類的方式將肺結(jié)節(jié)劃分為AAH、AIS、MIA、IA四個亞類,給出早期浸潤程度建議,更為深入的探究患者肺結(jié)節(jié)的情況。

在128例測試集上,多任務(wù)深度學(xué)習(xí)模型預(yù)測的結(jié)果優(yōu)于4位放射科醫(yī)生(兩位高年資醫(yī)師和兩位低年資醫(yī)生)的評價結(jié)果。該模型在區(qū)分浸潤/非浸潤兩分類的準(zhǔn)確率達(dá)到了78.8%(AUC),區(qū)分IAC/非IAC(0期/I期)兩分類的準(zhǔn)確率達(dá)到了88.0%(AUC),區(qū)分AAH-AIS/MIA/IAC三分類的準(zhǔn)確率達(dá)到了63.3%(F1)。

該研究中使用的亞厘米肺結(jié)節(jié)數(shù)據(jù)大部分為肺磨玻璃結(jié)節(jié),這種類型的結(jié)節(jié),特別是亞厘米磨玻璃結(jié)節(jié),在CT圖像上由于傳統(tǒng)的惡性征象較少出現(xiàn),浸潤前病變和浸潤性病變影像表現(xiàn)重疊較高等特征,診斷十分困難,在三分類的診斷上,高年資醫(yī)師的診斷正確率也只有56.6%,而點(diǎn)內(nèi)的深度學(xué)習(xí)準(zhǔn)確率可達(dá)到63.3%,由此可見深度學(xué)習(xí)在處理這類問題時的優(yōu)勢與前景。

本文從構(gòu)思到發(fā)表,經(jīng)歷了數(shù)據(jù)采集、像素級標(biāo)注、數(shù)據(jù)處理、模型開發(fā)訓(xùn)練、模型測試、公共數(shù)據(jù)集申請、下載、標(biāo)注、測試、論文的攥寫、修改、同行評閱、修回等過程,點(diǎn)內(nèi)的聯(lián)合研究團(tuán)隊只用了不到9個月時間便完成了算法開發(fā)測試及論文發(fā)表工作。

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