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Adaptive Biotech: 用基因測(cè)序解碼自適應(yīng)免疫系統(tǒng),受微軟、羅氏青睞

說起一滴血檢測(cè)癌癥,很多人可能都會(huì)因?yàn)門heranos的驚天騙局而對(duì)此嗤之以鼻。雖然Theranos的90億估值泡沫破滅,但是一滴血測(cè)量疾病這項(xiàng)技術(shù)本身的價(jià)值不能被磨滅。

在硅谷,還有一家持續(xù)看好滴血測(cè)癌癥的公司:Adaptive Biotechnologies。不同于Theranos高調(diào)張揚(yáng)的作風(fēng),Adaptive Biotechnologies更加務(wù)實(shí)低調(diào)。根據(jù)斯坦福大學(xué)的一篇統(tǒng)計(jì)調(diào)查顯示,在醫(yī)療領(lǐng)域的諸多獨(dú)角獸發(fā)表的論文中,23andMe和 Adaptive Biotechnologies發(fā)表論文最多,前者發(fā)表了 107 篇論文,后者則是 89 篇。兩家公司發(fā)表論文的數(shù)量之和,撐起了所有醫(yī)療領(lǐng)域獨(dú)角獸發(fā)文數(shù)量的半壁江山。

雖然發(fā)表了較多論文,但Adaptive不是一家科研機(jī)構(gòu),Adaptive Biotechnologies是一家美國(guó)西雅圖的測(cè)序分析平臺(tái)研發(fā)商,該公司希望創(chuàng)建通用血液測(cè)試和開發(fā)新的癌癥治療方法,以改善患者病情。

總體來看,Adaptive擁有三大產(chǎn)品線,分別是生命科學(xué)研究、臨床診斷、藥物發(fā)現(xiàn),這三大管線中,clonoSEQ已經(jīng)實(shí)現(xiàn)商業(yè)化。這三大產(chǎn)品線還獲得包括微軟、羅氏旗下基因泰克、艾伯維等巨頭的認(rèn)可,達(dá)成了長(zhǎng)期合作。在今年6月,Adaptive已經(jīng)在納斯達(dá)克IPO。

Adaptive的CEO Chad Robin表示:“我們有兩種商業(yè)產(chǎn)品,以及強(qiáng)大的臨床渠道,可以診斷,監(jiān)測(cè)和治療癌癥,自身免疫性疾病和傳染病等疾病。我們的目標(biāo)是開發(fā)和商業(yè)化針對(duì)每個(gè)患者的免疫驅(qū)動(dòng)臨床產(chǎn)品!

 

融資歷程.png

Adaptive Biotechnologies融資歷史

成為一家開發(fā)療法的體外診斷公司

Adaptive 成立于2009年,它的目標(biāo)是開發(fā)和商業(yè)化針對(duì)每個(gè)患者的免疫驅(qū)動(dòng)臨床產(chǎn)品。Adaptive擁有專有的T細(xì)胞抗原受體(TCR)發(fā)現(xiàn)和免疫分析平臺(tái)TruTCR。

Apdptive的官網(wǎng)上寫著這樣一段話:“我們認(rèn)為,適應(yīng)性免疫系統(tǒng)是自然界中對(duì)大多數(shù)疾病進(jìn)行最精細(xì)調(diào)整的診斷和治療方法,但無法對(duì)其進(jìn)行解碼使醫(yī)學(xué)界無法充分利用其功能。我們專有的免疫醫(yī)學(xué)平臺(tái)以前所未有的規(guī)模,精度和速度揭示并翻譯了適應(yīng)性免疫系統(tǒng)的大量遺傳學(xué)信息,從而開發(fā)出了生命科學(xué)研究,臨床診斷和藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的產(chǎn)品!

適應(yīng)性免疫應(yīng)答( adaptive immune response)是指體內(nèi)抗原特異性T/B淋巴細(xì)胞接受抗原刺激后,自身活化、增殖、分化為效應(yīng)細(xì)胞,產(chǎn)生一系列生物學(xué)效應(yīng)的全過程。

關(guān)于Adaptive,它的核心定義是體外診斷公司,但它的業(yè)務(wù)已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)打破了傳統(tǒng)體外診斷企業(yè)的局限。在診斷方面,Adaptive希望通過基因測(cè)序的方式實(shí)現(xiàn)早期的癌癥發(fā)現(xiàn),同時(shí),adaptive還希望利用診斷測(cè)序平臺(tái)開發(fā)更多免疫腫瘤治療方法。如今,adaptive每年與超過125個(gè)生物制藥合作伙伴合作。

本質(zhì)上,Adaptive Biotechnologies是將把人體免疫系統(tǒng)本身變成診斷的數(shù)據(jù)源。因?yàn)槊看蚊庖呦到y(tǒng)對(duì)疾病做出反應(yīng)時(shí),T細(xì)胞受體(TCR)蛋白就會(huì)被表達(dá)出來以識(shí)別抗原。根據(jù)微軟和Adaptive postulate的方法,通過簡(jiǎn)單的血檢來繪制TCRs圖譜,對(duì)一系列疾病的早期診斷大有幫助。

我們的免疫系統(tǒng)知道的所有信息都被編碼成免疫細(xì)胞的基因,如T細(xì)胞和B細(xì)胞,它們漂浮在我們的血液中。

簡(jiǎn)單來說,T細(xì)胞是人體里的特種兵,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的精準(zhǔn)打擊。B細(xì)胞就像人體里的導(dǎo)彈庫(kù),在病毒入侵身體不久,B細(xì)胞和T細(xì)胞跟他進(jìn)行信息的交換后,B細(xì)胞就會(huì)趕緊分解自己,在短時(shí)間內(nèi)復(fù)制出大量的B細(xì)胞,裝了一肚子導(dǎo)彈的B細(xì)胞,那下一步就是發(fā)射了,在一秒鐘內(nèi)一個(gè)B細(xì)胞大約可以發(fā)射2000發(fā)導(dǎo)彈,發(fā)射的這些導(dǎo)彈,被我們稱為抗體。

Adaptive Biotechnologies公司使用稱為下一代測(cè)序的技術(shù)來讀取這些細(xì)胞的基因,并創(chuàng)建了一個(gè)由數(shù)十億數(shù)據(jù)點(diǎn)組成的免疫譜。

Adaptive Biotechnologies已經(jīng)找到對(duì)T細(xì)胞和B細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序的方法。對(duì)這些受體進(jìn)行基因組測(cè)序是困難的,因?yàn)樗鼈兊幕驎?huì)隨著時(shí)間重新排列。但Adaptive已經(jīng)找到了一種方法,利用其強(qiáng)大的ImmunoSEQ平臺(tái),利用計(jì)算生物學(xué)來對(duì)受體進(jìn)行測(cè)序。

產(chǎn)品管線.png

Adaptive戰(zhàn)略與合作伙伴

Adaptive如何實(shí)現(xiàn)廣泛用途

那么問題來了,Adaptive的TruTCR和ImmunoSEQ主要用于哪些方面?有哪些成功應(yīng)用的案例呢?

首先是疾病的早期診斷和個(gè)體化的治療。

Adaptive已與Microsoft Healthcare NExT計(jì)劃合作,以繪制和解碼人類免疫系統(tǒng)。雙方將一起通過免疫測(cè)序、專有計(jì)算模型和機(jī)器學(xué)習(xí)將TCR序列映射到它們結(jié)合的抗原。利用這些數(shù)據(jù)構(gòu)建一張地圖,將數(shù)百萬個(gè)T細(xì)胞與數(shù)百萬個(gè)專門針對(duì)其攻擊的病原體聯(lián)系起來,從而使疾病的診斷更加有效和準(zhǔn)確。最終實(shí)現(xiàn)為所有疾。◤陌┌Y到自身免疫性疾病再到傳染性疾病)提供更好的診斷的目的。

和微軟合作主要是獲取微軟的云計(jì)算及機(jī)器學(xué)習(xí)相關(guān)業(yè)務(wù)。從機(jī)學(xué)習(xí)算法的角度來看,Adaptive Biotechnologies與微軟合作的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,不同于IBM Waston的自然語言處理和機(jī)器學(xué)習(xí),也并非是圖像識(shí)別相關(guān)算法。微軟正在和合作伙伴開發(fā)一種應(yīng)用于醫(yī)療保健的獨(dú)特方法。

除了用于精準(zhǔn)診斷,Adaptive的產(chǎn)品還可以用于細(xì)胞療法開發(fā)。

2019年1月,Adaptive與羅氏旗下的Genentech達(dá)成合作。Adaptive將使用其研究性TCR發(fā)現(xiàn)平臺(tái)來確定患者體內(nèi)最佳的T細(xì)胞抗原受體,以便能夠最有效針對(duì)每位患者的個(gè)性化抗原進(jìn)行治療。而Genentech則將根據(jù)Adaptive提供的信息設(shè)計(jì)和制造個(gè)性化的細(xì)胞藥物,以便為每位患者提供更好的治療服務(wù)。

憑借在TCR平臺(tái)的實(shí)力,Adaptive Biotechnologies也是TCR-T療法領(lǐng)域的明星公司。其擁有的TruTCR T細(xì)胞受體(TCR)篩查平臺(tái)可通過免疫測(cè)序和其他技術(shù)來鑒定和表征有效結(jié)合靶抗原的TCR。

TCR-T療法是一種過繼免疫細(xì)胞治療(Adoptive Cell Transfer Therapy,ACT)。過繼免疫細(xì)胞治療是指從腫瘤患者體內(nèi)分離免疫活性細(xì)胞,在體外進(jìn)行擴(kuò)增和功能鑒定,然后向患者回輸,從而達(dá)到直接殺傷腫瘤或激發(fā)機(jī)體的免疫應(yīng)答殺傷腫瘤細(xì)胞的目的。

TCR-T療法的基本步驟是:首先鑒定出一種或多種腫瘤抗原作為治療靶點(diǎn),再獲得特異識(shí)別腫瘤抗原的的TCR序列;然后采用基因工程技術(shù),將編碼抗原特異的TCR基因序列導(dǎo)入患者自身T細(xì)胞中,從而獲得特異識(shí)別腫瘤抗原的TCR-T細(xì)胞。這些TCR-T細(xì)胞通過體外培養(yǎng)進(jìn)行大量擴(kuò)增之后,被回輸?shù)交颊唧w內(nèi)以殺死腫瘤細(xì)胞。

管線進(jìn)展.png

 

Adaptive目前的管線

值得一提的是,Adaptive的野心并不是空談,它已經(jīng)有多個(gè)產(chǎn)品獲得FDA批準(zhǔn)。FDA通過de novo 審批通道授予clonoSEQ Assay檢測(cè)和商業(yè)化許可,clonoSEQ Assay可使用骨髓樣本中的DNA檢測(cè)和監(jiān)測(cè)多發(fā)性骨髓瘤(MM)和B細(xì)胞急性淋巴細(xì)胞性白血病(ALL)患者的最小殘留疾。∕RD)。其旗下ClonoSEQ MRD平臺(tái),對(duì)血液中的MRD(微小殘留白血病)極敏感,可以檢測(cè)到低至1個(gè)細(xì)胞的水平。

clonoSEQ是第一個(gè)也是唯一一個(gè)FDA授權(quán)的用于MRD測(cè)試的體外診斷測(cè)定法。同時(shí)也是第一個(gè)通過免疫測(cè)序技術(shù)獲得FDA批準(zhǔn)的臨床診斷工具。

clonoSEQ利用Adaptive的專有免疫測(cè)序平臺(tái)來鑒定和定量惡性細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的特定DNA序列,使臨床醫(yī)生可以在治療期間和治療之后評(píng)估和監(jiān)測(cè)MRD。該檢測(cè)方法可對(duì)MRD進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化,準(zhǔn)確和靈敏的測(cè)量,從而使醫(yī)生能夠預(yù)測(cè)患者的預(yù)后,評(píng)估隨時(shí)間推移對(duì)治療的反應(yīng),在緩解期間監(jiān)視患者并檢測(cè)潛在的復(fù)發(fā)。血液惡性腫瘤的臨床實(shí)踐指南認(rèn)識(shí)到,MRD狀態(tài)是臨床結(jié)果和對(duì)治療反應(yīng)的可靠指標(biāo),并且臨床結(jié)果與診斷為ALL和MM的患者的clonoSEQ Assay測(cè)量的MRD水平密切相關(guān)。

Adaptive的clonoSEQ還獲得了藥企AbbVie的青睞,將clonoSEQ用于藥物研發(fā)中,clonoSEQ作為一種準(zhǔn)確可靠的方法來評(píng)估對(duì)新療法對(duì)于患者生活水平的改善。在2019年12月雙方達(dá)成了一項(xiàng)多年期合作。雙方的合作是以支持AbbVie的藥物venetoclax在多發(fā)性骨髓瘤這一疾病中的臨床試驗(yàn)。

眾所周知,精準(zhǔn)診斷和個(gè)性化醫(yī)療是疾病治療的未來趨勢(shì)。但繪制一個(gè)人的基因圖譜,并考慮他們的表觀遺傳學(xué)和他們的生活方式等已經(jīng)足夠復(fù)雜,而這對(duì)于疾病診斷和治療還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。如果TCRs可以被繪制出來,從而可以更快地診斷。但目前還不清楚的是,映射的TCRs是否真的能夠?yàn)楦喾N類的疾病提供必要的診斷線索。然而,它可能與遺傳學(xué)、表觀遺傳學(xué)和其他健康數(shù)據(jù)來源一起,補(bǔ)充診斷工作。

兄弟創(chuàng)業(yè),希望打造免疫診斷領(lǐng)域MRI

Adaptive Biotechnologies由Harlan和 Chad Robin兩兄弟共同創(chuàng)立。2009年9月,Robin和他的兄弟創(chuàng)立了這家公司。 Chad負(fù)責(zé)公司管理,尋找商業(yè)伙伴。ChadRobin擁有賓夕法尼亞大學(xué)沃頓商學(xué)院的MBA學(xué)位和康奈爾大學(xué)的管理經(jīng)濟(jì)學(xué)學(xué)士學(xué)位。

而哈蘭是首席科學(xué)官,他在弗雷德·哈欽森(Fred Hutch)癌癥研究中心擔(dān)任計(jì)算生物學(xué)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人長(zhǎng)達(dá)13年。(哈蘭曾在Adaptive和Fred Hutch擔(dān)任雙重職位,直到Adaptive申請(qǐng)IPO時(shí)離開Fred Hutch)。

除了兩兄弟,Adaptive的總裁Julie Rubinstein曾在輝瑞公司(Pfizer Inc.)的腫瘤學(xué)部門擔(dān)任全球商業(yè)發(fā)展職務(wù),主要致力于癌癥免疫療法。

有趣的是, Chad Robin曾在采訪中表示,公司的成功歸功于他母親,因?yàn)槟赣H常常會(huì)耐心地傾聽,同時(shí)調(diào)停兩人之間的矛盾。

Adaptive的CEO Chad Robins一次采訪中表示:“最終,這將成為‘免疫檢查’或年度體檢的其中一部分,它將對(duì)人們的生物系統(tǒng)進(jìn)行檢查。就像用進(jìn)行核磁共振或x射線對(duì)我們的免疫系統(tǒng)進(jìn)行檢查一樣普遍!彼J(rèn)為第一次基于免疫系統(tǒng)的檢測(cè)將在未來兩年內(nèi)進(jìn)行。


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