科學(xué)家開發(fā)了研究線粒體的新技術(shù)
科學(xué)家開發(fā)了研究線粒體的新技術(shù),這一進(jìn)展為研究包括阿爾茨海默病、帕金森病和其他癌癥在內(nèi)的線粒體被破壞的疾病提供了一種新方法。
斯克里普斯研究所
2023年2月15日消息
近日在線發(fā)表在《細(xì)胞生物學(xué)雜志》(Journal of Cell Biology,JCB)上的一項(xiàng)研究報(bào)告中,斯克里普斯研究所(Scripps Research)的科學(xué)家們描述了一項(xiàng)新技術(shù),能夠對(duì)線粒體內(nèi)甚至是細(xì)微的結(jié)構(gòu)變化進(jìn)行成像和量化,并將這些變化與細(xì)胞中正在進(jìn)行的其他過程相關(guān)聯(lián)。
研究于2023年2月14日發(fā)表在《Journal of Cell Biology》(最新影響因子:8.077)雜志上
線粒體不僅參與能量的產(chǎn)生,而且還參與其他幾種關(guān)鍵的細(xì)胞功能,包括細(xì)胞分裂和對(duì)各種類型的應(yīng)激的細(xì)胞保存反應(yīng)。線粒體功能障礙已在包括阿爾茨海默病、帕金森病和不同癌癥在內(nèi)的許多疾病中被觀察到,研究人員渴望開發(fā)出可以逆轉(zhuǎn)這些功能障礙的治療方法。但研究線粒體結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)的科學(xué)工具有限。
“我們現(xiàn)在有了一個(gè)強(qiáng)大的新工具包,可以檢測(cè)和量化線粒體的結(jié)構(gòu)和功能差異,例如,在疾病和健康狀態(tài)下,”該研究的資深作者 Danielle Grotjahn 博士說,她是斯克里普斯研究所綜合結(jié)構(gòu)和計(jì)算生物學(xué)部的助理教授。
該研究的共同第一作者是 Grotjahn 實(shí)驗(yàn)室成員 Benjamin Barad 博士(博士后研究助理)和 Michaela Medina 博士候選人。
線粒體是存在于動(dòng)植物細(xì)胞內(nèi)的眾多膜結(jié)合分子機(jī)器或“細(xì)胞器”之一。通常每個(gè)細(xì)胞有數(shù)百到數(shù)千個(gè)線粒體,它們有自己的小基因組,并且有一個(gè)獨(dú)特的結(jié)構(gòu),有一個(gè)外膜和一個(gè)波浪形的內(nèi)膜,關(guān)鍵的生化反應(yīng)在這里發(fā)生?茖W(xué)家們知道,線粒體結(jié)構(gòu)的外觀可以發(fā)生巨大變化,這取決于線粒體在做什么,或者細(xì)胞中存在什么壓力。因此,這些結(jié)構(gòu)變化可以成為細(xì)胞狀況的非常有用的標(biāo)記,盡管到目前為止還沒有一個(gè)很好的方法來檢測(cè)和量化它們。
在這項(xiàng)研究中,Grotjahn 的團(tuán)隊(duì)整合了一個(gè)計(jì)算工具包來處理來自一種叫做冷凍電子斷層掃描(cryo-ET)的顯微鏡技術(shù)的成像數(shù)據(jù),這種技術(shù)基本上是用電子而不是光在三維中成像生物樣本。研究人員稱之為“表面形態(tài)測(cè)量工具包”(surface morphometrics toolkit),能夠?qū)蝹(gè)線粒體的結(jié)構(gòu)單元進(jìn)行詳細(xì)的繪制和測(cè)量。這包括內(nèi)膜的彎曲和膜之間的間隙,這是所有可能有用的重要線粒體和細(xì)胞事件的標(biāo)志。
Barad 說:“它使我們能夠從本質(zhì)上把我們從冷凍胚胎移植中獲得的線粒體的美麗的三維圖像轉(zhuǎn)化為敏感的、定量的測(cè)量,例如,我們可以潛在地利用它來幫助識(shí)別疾病的詳細(xì)機(jī)制!
研究小組展示了這個(gè)工具包,他們用它來繪制細(xì)胞受到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激(一種常見于神經(jīng)退行性疾病的細(xì)胞應(yīng)激)時(shí)線粒體的結(jié)構(gòu)細(xì)節(jié)。他們觀察到,關(guān)鍵結(jié)構(gòu)特征,如內(nèi)膜的曲率,或內(nèi)外膜之間的最小距離,在這種應(yīng)激下發(fā)生了可測(cè)量的變化。
隨著新工具包的成功、原理驗(yàn)證演示,Grotjahn 實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)在將用它來更詳細(xì)地研究線粒體如何對(duì)細(xì)胞應(yīng)激或由疾病、毒素、感染甚至藥物引起的其他變化作出反應(yīng)。
“例如,我們可以比較藥物對(duì)細(xì)胞線粒體的影響和對(duì)未治療線粒體的影響,” Medina 說,“這種方法不僅限于線粒體,我們也可以用它來研究細(xì)胞內(nèi)的其他細(xì)胞器!
“使用表面形態(tài)測(cè)量管道量化低溫電子層析成像中的細(xì)胞器超微結(jié)構(gòu)”(Quantifying organellar ultrastructure in cryo-electron tomography using a surface morphometrics pipeline)由Benjamin Barad, Michaela Medina, Daniel Fuentes, Luke Wiseman 和 Danielle Grotjahn 共同撰寫,他們均來自斯克里普斯研究所。
創(chuàng)立于1924年的斯克里普斯研究所
參考文獻(xiàn)
Source:Scripps Research
Scripps Research scientists develop new technique for studying mitochondria
Reference:
Benjamin A. Barad, Michaela Medina, Daniel Fuentes, R. Luke Wiseman, Danielle A. Grotjahn; Quantifying organellar ultrastructure in cryo-electron tomography using a surface morphometrics pipeline. J Cell Biol 3 April 2023; 222 (4): e202204093. doi: https://doi.org/10.1083/jcb.202204093
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