選擇性剪接在神經(jīng)退行性疾病中發(fā)揮什么作用?
科學(xué)家們寫了一篇綜述,討論選擇性剪接缺陷在主要神經(jīng)退行性疾病中的作用的新研究和證據(jù)。他們還總結(jié)了針對(duì)這些疾病的基于 RNA 的治療策略的最新進(jìn)展。
加州大學(xué)河濱分校
6月20日消息
選擇性剪接(Alternative splicing)是細(xì)胞產(chǎn)生許多不同變體的信使 RNA (參與蛋白質(zhì)合成的單鏈 RNA)的一種巧妙方式,在分子生物學(xué)中發(fā)揮著重要作用。選擇性剪接領(lǐng)域進(jìn)展迅速,是一個(gè)復(fù)雜的話題,科學(xué)文獻(xiàn)已經(jīng)非常廣泛。
David Nikom是加州大學(xué)河濱分校(University of California – Riverside,UCR)神經(jīng)科學(xué)研究生項(xiàng)目的學(xué)生,他的導(dǎo)師 Sika Zheng 是加州大學(xué)河濱分校醫(yī)學(xué)院(UCR School of Medicine)的生物醫(yī)學(xué)副教授和 RNA 生物學(xué)與醫(yī)學(xué)中心的主任,他們?cè)凇?strong>自然-綜述神經(jīng)科學(xué)》(Nature Reviews Neuroscience)上寫了一篇綜述,討論了選擇性剪接缺陷在主要神經(jīng)退行性疾病中作用的新興研究和證據(jù)。他們還總結(jié)了靶向這些疾病的基于 RNA 的治療策略的最新進(jìn)展。
研究于2023年6月19日發(fā)表在《Nature Reviews Neuroscience》(最新影響因子:38.755)雜志上
他們認(rèn)為,鑒于全球范圍內(nèi)神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病率不斷增加,以及迫切需要新的治療和管理方法,選擇性剪接在神經(jīng)退行性疾病中的主題尤其相關(guān)。他們認(rèn)為,由于異常剪接失調(diào)常見(jiàn)于神經(jīng)退行性疾病,因此理解 RNA 療法的前景非常重要,也非常適合進(jìn)行綜述。
他們的綜述題為“神經(jīng)退行性疾病中的選擇性剪接和 RNA 療法的前景”( Alternative splicing in neurodegenerative disease and the promise of RNA therapies),旨在為對(duì)該主題感興趣的科學(xué)受眾提供全面的、綜合性的知識(shí)。它綜合了全球許多實(shí)驗(yàn)室在阿爾茨海默病、帕金森病、亨廷頓病、肌萎縮側(cè)索硬化癥(ALS)、額顳葉失智等數(shù)十年研究中的知識(shí)和發(fā)現(xiàn)。這項(xiàng)工作得到了美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院(NIH)資助。
在接下來(lái)的問(wèn)答環(huán)節(jié)中,Sika Zheng 和 David Nikom 將重點(diǎn)闡述這篇文章的要點(diǎn)。
該研究的兩位作者David Nikom和Sika Zheng
問(wèn):什么是選擇性剪接失調(diào)?
一旦一個(gè)基因的 DNA 被轉(zhuǎn)錄成前信使 RNA(即剪接前的 RNA),只有一小部分前信使 RNA 會(huì)形成最終的信使 RNA(mRNA),即編碼蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄物。選擇性剪接是一個(gè)細(xì)胞可以選擇哪些蛋白質(zhì)編碼部分包括在最終的 RNA 或蛋白質(zhì)的過(guò)程。選擇性剪接失調(diào)是當(dāng)這個(gè)過(guò)程以某種方式出錯(cuò)時(shí)。細(xì)胞選擇包含錯(cuò)誤的蛋白質(zhì)編碼部分或排除一些正確的部分。這可能會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)生的蛋白質(zhì)出現(xiàn)各種問(wèn)題:它可能比預(yù)期的要短,從而破壞其在細(xì)胞中的正常功能,或者可能導(dǎo)致蛋白質(zhì)根本無(wú)法產(chǎn)生。
問(wèn):選擇性剪接在分子生物學(xué)中發(fā)揮什么作用?
選擇性剪接極大地?cái)U(kuò)展了單一基因所能合成的蛋白質(zhì)的多樣性。這一點(diǎn)很重要,因?yàn)槎嗉?xì)胞生物會(huì)產(chǎn)生許多不同類型的細(xì)胞,這些細(xì)胞構(gòu)成了它們身體的不同組織類型。但是每個(gè)細(xì)胞只有相同的遺傳密碼。為了產(chǎn)生復(fù)雜得令人眼花繚亂的多細(xì)胞生命,細(xì)胞依靠選擇性剪接的靈活性來(lái)制造具有不同組織特異性和發(fā)育階段特異性功能的相似蛋白大家族。例如,某些選擇性剪接網(wǎng)絡(luò)只在胚胎發(fā)育期間被激活,在生物體成熟時(shí)被關(guān)閉。
問(wèn):簡(jiǎn)單地說(shuō),它是如何促進(jìn)廣泛的神經(jīng)退行性疾病的分子病理學(xué)的?
某些器官比其他器官更依賴選擇性剪接來(lái)產(chǎn)生細(xì)胞多樣性。我們不知道為什么,但大腦比身體的其他器官有更多的選擇性剪接?茖W(xué)家們推測(cè),這可能是由于大腦獨(dú)特的復(fù)雜性、快速進(jìn)化,或者它所包含的細(xì)胞類型的非凡多樣性。我們所知道的是,在神經(jīng)系統(tǒng)疾病中,有很多大腦特異性的選擇性剪接事件總是出錯(cuò)。這些疾病包括神經(jīng)發(fā)育障礙,如自閉癥譜系障礙,或神經(jīng)退行性疾病,如阿爾茨海默病或 ALS。到目前為止,我們了解的最好的例子與 ALS 的異常選擇性剪接有關(guān)?茖W(xué)家發(fā)現(xiàn),這些錯(cuò)誤的剪接事件會(huì)導(dǎo)致異常蛋白的產(chǎn)生或正常蛋白的減少,最終影響神經(jīng)元的健康和功能。伴有選擇性剪接失調(diào)的其他一些神經(jīng)退行性疾病包括額顳葉失智、帕金森病、家族性自主神經(jīng)功能障礙、亨廷頓病、脊髓性肌萎縮癥和杜氏肌營(yíng)養(yǎng)不良。
問(wèn):選擇性剪接在其他疾病中也有作用嗎?
選擇性剪接與約 15% 的人類遺傳疾病和癌癥有關(guān)。調(diào)節(jié)選擇性剪接的成分中的突變是許多常見(jiàn)和罕見(jiàn)疾病的病因。強(qiáng)直性肌營(yíng)養(yǎng)不良、骨髓增生異常綜合征(骨髓癌)、視網(wǎng)膜變性疾。ㄈ缫暰W(wǎng)膜色素變性)和早衰癥(罕見(jiàn)的早衰綜合征)是剪接缺陷引起的疾病的突出例子。
問(wèn):您總結(jié)了靶向潛在剪接機(jī)制的基于 RNA 的治療策略的最新進(jìn)展。這些進(jìn)展有哪些?
靶向潛在剪接機(jī)制治療疾病的一個(gè)很好的例子是一種稱為脊髓性肌萎縮癥(SMA)的疾病,這是兒童和嬰兒的主要遺傳病。人類攜帶兩個(gè)幾乎相同的運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元生存(Survival Motor Neuron,SMN)基因拷貝:SMN1 和 SMN2,它們對(duì)所有動(dòng)物細(xì)胞的生存都是必不可少的。SMA 患者存在 SMN1 缺失,SMN2 是患者 SMN 蛋白的唯一來(lái)源。SMN1 和 SMN2 的關(guān)鍵區(qū)別在于外顯子 7 的剪接,外顯子 7 是 SMN 基因內(nèi)的一小段蛋白編碼序列。與 SMN1 外顯子 7 不同,SMN2 外顯子 7 通常不包含在大多數(shù)組織中。由 SMN2 產(chǎn)生的外顯子 7 跳過(guò)的轉(zhuǎn)錄物產(chǎn)生一種部分有功能且不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)。首個(gè)獲批的 SMA 治療藥物靶向 SMN2 前 mRNA,并與剪接機(jī)制接觸的區(qū)域結(jié)合,從而去除外顯子 7。這最終導(dǎo)致阻斷外顯子 7 的去除,并促進(jìn)功能性 SMN 蛋白的形成。通過(guò)促進(jìn)外顯子 7 的剪接,該藥物(Spinraza)增加了來(lái)自 SMN2 基因的細(xì)胞中的 SMN 表達(dá),補(bǔ)償 SMN1 的丟失,并防止了中樞神經(jīng)系統(tǒng)細(xì)胞的丟失。
這個(gè)故事是剪接機(jī)制可以靶向治療兒童致命疾病的典型例子。我們希望了解更多的剪接機(jī)制,并找到新的方法以它們?yōu)榘悬c(diǎn)治療其他疾病。
一些最新的進(jìn)展:
用于 tau 蛋白。ò橛挟惓 tau 蛋白沉積的神經(jīng)退行性疾病)的剪接切換寡核苷酸(如 Spinraza),可以糾正大腦中致病亞型(tau- RNA 變異體)的平衡
靶向淀粉樣蛋白的剪接寡核苷酸可減少阿爾茨海默病小鼠的腦斑塊
剪接體介導(dǎo)的 RNA 反式剪接(SMaRT)——基因重編程系統(tǒng),通過(guò)替換剪接位點(diǎn)上游或下游的整個(gè)編碼序列來(lái)糾正異常剪接的 mRNA
靶向 RNA 的 CRISPR 方法可以逆轉(zhuǎn)剪接缺陷,而不像傳統(tǒng)基因療法那樣改變患者的基因組
創(chuàng)立于1907年的加州大學(xué)河濱分校
參考文獻(xiàn)
Source:University of California - Riverside
What role does alternative splicing play in neurodegenerative disease?
Reference:
Nikom, D., Zheng, S. Alternative splicing in neurodegenerative disease and the promise of RNA therapies. Nat Rev Neurosci (2023). https://doi.org/10.1038/s41583-023-00717-6
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原文標(biāo)題 : 選擇性剪接在神經(jīng)退行性疾病中發(fā)揮什么作用?
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