ggcorrplot包是基于ggplot2的擴(kuò)展包，主要針對相關(guān)系數(shù)輸出的結(jié)果進(jìn)行可視化， 同時計(jì)算相關(guān)性p－value，可以實(shí)現(xiàn)選擇顏色，文本標(biāo)簽，顏色標(biāo)簽，布局等的操作。

相關(guān)系數(shù)的值在 －1～1之間，1表示強(qiáng)正相關(guān)，0不相關(guān)。

相關(guān)圖是基于相關(guān)系數(shù)矩陣?yán)L制的圖，如果是橢圓：則橢圓的色相對應(yīng)相關(guān)性的正負(fù)，顏色深淺對應(yīng)相關(guān)性絕對值大小，越深則絕對值越大。橢圓的形狀對應(yīng)相關(guān)性絕對值大小，默認(rèn)越扁，則相關(guān)性絕對值越大。如果是圓，則圓的面積對應(yīng)相關(guān)性大小，如果是扇形，則扇形的弧度對應(yīng)相關(guān)性大小。

安裝加載install．packages（＂ggcorrplot＂）library（ggplot2）library（ggcorrplot）

加載ggcorrplot前需先加載ggplot包，否則無法運(yùn)行！

相關(guān)參數(shù)參數(shù)用法method指定可視化的形狀，可以是circle圓形，square方形（默認(rèn)）。type指定顯示范圍，可以是full完全（默認(rèn)），lower下三角，upper上三角ggthemeggplot2函數(shù)或主題對象。默認(rèn)值為“theme＿minimal”。允許的值是官方的ggplot2主題，包括theme＿gray、theme＿bw、theme＿minimal、theme＿classic、theme＿void…。title圖片標(biāo)題show．legend邏輯，如果為真，則顯示圖例legend．title圖例標(biāo)題show．diag是否在主對角線上顯示相關(guān)系數(shù)colors低、中、高相關(guān)值的3種顏色的向量outline．color正方形或圓形的輪廓顏色。默認(rèn)值為“灰色”。hc．order邏輯值。如果為真，則使用hclust函數(shù)對相關(guān)矩陣進(jìn)行排序。hc．method是否為相關(guān)系數(shù)繪圖，默認(rèn)為TRUE，F(xiàn)ALSE則可將其它數(shù)字矩陣進(jìn)行可視化。lab邏輯值。如果為真，則在繪圖上添加相關(guān)系數(shù)。lab＿col相關(guān)系數(shù)標(biāo)簽的顏色lab＿size相關(guān)系數(shù)標(biāo)簽的大小pch在不顯著相關(guān)系數(shù)的圖示符上添加字符（僅當(dāng)insig為“pch”時有效）。默認(rèn)值為4。tl．cex文本標(biāo)簽的大小tl．col文本標(biāo)簽的顏色tl．srt文本標(biāo)簽字符串旋轉(zhuǎn)digits決定要顯示的小數(shù)位數(shù)（默認(rèn)值：“2”）

請參閱help（ggcorrplot2）幫助文檔

示例

本文以R內(nèi)置的mtcars數(shù)據(jù)集為例

ggcorrplot（cor（mtcars）＃改變可視化形狀ggcorrplot（corr， method ＝ ＂circle＂）

＃顯示圓形的輪廓ggcorrplot（corr， method ＝ ＂circle＂，outline．color ＝ ＂red＂）

＃旋轉(zhuǎn)文本字符串ggcorrplot（corr， method ＝ ＂circle＂，outline．color ＝ ＂red＂，tl．srt ＝ TRUE）

�？刂凭仃囆螤� 下三角形ggcorrplot（corr，method ＝ ＂circle＂， hc．order ＝ TRUE， type ＝ ＂lower＂）

＃上三角形ggcorrplot（corr，method ＝ ＂circle＂， hc．order ＝ TRUE， type ＝ ＂upper＂）

＃更改顏色以及主題ggcorrplot（corr， hc．order ＝ TRUE， type ＝ ＂lower＂， outline．color ＝ ＂white＂，ggtheme ＝ ggplot2：：theme＿gray， colors ＝ c（＂＃6D9EC1＂， ＂white＂， ＂＃E46726＂））

＃添加相關(guān)系數(shù)ggcorrplot（corr， hc．order ＝ TRUE， type ＝ ＂lower＂， lab ＝ TRUE）

＃顯示對角線上相關(guān)系數(shù)ggcorrplot（corr， show．diag ＝ TRUE， type ＝ ＂lower＂， lab ＝ TRUE）

＃增加顯著性水平，不顯著的話就不添加了ggcorrplot（corr， hc．order ＝ TRUE， type ＝ ＂lower＂， p．mat ＝ p．mat）

＃將不顯著的色塊設(shè)置成空白ggcorrplot（corr， p．mat ＝ p．mat， hc．order＝TRUE， type ＝ ＂lower＂， insig ＝ ＂blank＂）

＃低于p值為空ggcorrplot（corr， hc．order ＝ TRUE，type＝＂full＂，colors＝c（＂cyan＂，＂white＂，＂magenta＂），tl．cex ＝ 10，tl．col ＝ ＂blue＂，digits ＝ 1，ggtheme＝theme＿bw（））

在此僅列出部分示例圖，大家可以更改參數(shù)在R中實(shí)現(xiàn)．

小結(jié)

1．ggcorrplot包是用于對相關(guān)矩陣重排序以及在相關(guān)圖中展示顯著性水平的方法。

2．另外一個可用展示相關(guān)系數(shù)的就是corrplot包了，相對于ggcorrplot包擁有更豐富的參數(shù)，更直觀地展示統(tǒng)計(jì)結(jié)果，例如method參數(shù)，ggcorrplot可以是circle圓形，square方形（默認(rèn)），而corrplot包，指定可視化的形狀，可以是circle圓形（默認(rèn)），square方形，ellipse， 橢圓形，number數(shù)值，shade陰影，color顏色，pie餅圖，展現(xiàn)形式更為豐富。corrplot包中有一些在ggcorrplot包中無法實(shí)現(xiàn)的參數(shù)，如addCoefasPercent、hclust．method等，具體可參照公眾號corrplot包的介紹。

3．ggcorrplot包作為ggplot2的擴(kuò)展包，使用前需先加載ggplot2包，可以實(shí)現(xiàn)ggplot2的強(qiáng)大繪圖功能，如還需展現(xiàn)其他非相關(guān)系數(shù)結(jié)果就更方便了，大家可以根據(jù)自己的習(xí)慣及數(shù)據(jù)需求選擇自己合適的包進(jìn)行數(shù)據(jù)展示。