該論文分析可以提供證據(jù)表明，新冠病毒不是人工合成的。

關(guān)于新冠病毒“人工合成”陰謀論的最“硬核”反駁來(lái)了！

2月18日，Scripps研究所的著名病毒進(jìn)化學(xué)家Kristian Andersen在preprint（預(yù)印本）的virological.org上發(fā)文反駁新冠病毒“人工合成”陰謀論。

作者通過(guò)對(duì)可用基因組序列數(shù)據(jù)的比較分析推導(dǎo)出新冠病毒的起源和早期進(jìn)化方法，并提供了有關(guān)新冠病毒基因組中顯著特征的觀點(diǎn)，基于此討論可能出現(xiàn)這些特征的場(chǎng)景要求。

最重要的是，該論文分析可以提供證據(jù)表明，新冠病毒不是人工合成的。

反駁新冠病毒是人工合成陰謀論的證據(jù)

首先論文對(duì)圖中描述的α和β冠狀病毒（Coronaviridae家族）的基因組進(jìn)行了比較，以此確定新冠病毒基因組所具有的兩個(gè)明顯特征：

1、基于結(jié)構(gòu)模型和早期生化實(shí)驗(yàn)可知，新冠病毒針對(duì)的是人與ACE2（宿主細(xì)胞受體血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2）受體結(jié)合；

2、新冠病毒在S蛋白的2個(gè)亞基S1/S2交界處有一個(gè)預(yù)測(cè)的多堿基切割位點(diǎn)。

因此Andersen先從SARS-CoV與ACE2結(jié)合最重要的RBD（受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域）的6個(gè)氨基酸殘基，Y442、L4772、N479、D480、T487、Y4911入手。

他發(fā)現(xiàn)：新冠病毒的相應(yīng)殘基為L(zhǎng)455、F486、S494、N501、Y505，與蝙蝠冠狀病毒RaTG13相比，有5個(gè)不同。新冠病毒S蛋白中第486位殘基的苯丙氨酸（F）對(duì)應(yīng)于SARS-CoV Urbani株中的L472，但F486并不是計(jì)算生物學(xué)預(yù)測(cè)時(shí)該位置點(diǎn)最優(yōu)化的氨基酸選擇。

并且，新冠病毒的RBD中幾個(gè)關(guān)鍵氨基酸殘基與計(jì)算生物學(xué)預(yù)測(cè)的最適合結(jié)合人ACE2受體的氨基酸殘基也完全不同。

所以Andersen認(rèn)為，從新冠病毒S蛋白結(jié)構(gòu)特征來(lái)看，新冠病毒并非是通過(guò)算法所預(yù)測(cè)最優(yōu)化的，而更像是自然選擇的。

其次，新冠病毒第2個(gè)明顯的特征是在S蛋白的2個(gè)亞基S1/S2交界處Furin蛋白酶切割位點(diǎn)（RRAR），除了兩個(gè)堿性精氨酸和一個(gè)切割位點(diǎn)的丙氨酸之外，還插入了一個(gè)脯氨酸。

脯氨酸插入產(chǎn)生的轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu)導(dǎo)致Furin蛋白酶切割位點(diǎn)側(cè)翼的S673、T678、S686發(fā)生添加O末端糖基化，而以前的β冠狀病毒均無(wú)Furin蛋白酶切割位點(diǎn)。

從SARS-CoV的體外實(shí)驗(yàn)中可知，在S1/S2交界處突變出這樣的位點(diǎn)，可以增強(qiáng)細(xì)胞-細(xì)胞融合，但并不影響病毒進(jìn)入。另外3個(gè)預(yù)測(cè)的O末端糖基化潛在功能還不清楚，但值得一提的是，它們可以產(chǎn)生一個(gè)“黏蛋白樣結(jié)構(gòu)域”，該結(jié)構(gòu)域可以屏蔽新冠病毒S蛋白上的潛在表位或者關(guān)鍵殘基。

但新冠病毒在體外培養(yǎng)體系中連續(xù)傳代極難同時(shí)獲得Furin蛋白酶切割位點(diǎn)和O末端糖基化。

第三個(gè)論據(jù)是病毒的宿主。新冠病毒與蝙蝠冠狀病毒RaTG13非常相似，所以蝙蝠是新冠病毒的宿主可能性很大。目前初步分析表明，非法進(jìn)口到廣東的馬來(lái)穿山甲可能是新冠病毒的中間宿主。

馬來(lái)穿山甲的冠狀病毒在6個(gè)關(guān)鍵RBD殘基上都與新冠病毒相同，但不同的是，馬來(lái)穿山甲的冠狀病毒不具有Furin蛋白酶切割位點(diǎn)，這意味著新冠病毒可能存在其他中間宿主，病毒在這些宿主身上形成了Furin蛋白酶切割位點(diǎn)，然后才傳播給了人。

而病毒要在中間宿主身上實(shí)現(xiàn)這種進(jìn)化的話(huà)，新冠病毒的中間動(dòng)物宿主必然具有極高的密度，這樣自然選擇才能快速發(fā)生。

因此從新冠病毒的S蛋白結(jié)構(gòu)特征、早期進(jìn)化以及人工合成所具備的條件等方面來(lái)看，新冠病毒是自然的選擇，而不是合成的。

關(guān)于新冠病毒為“人工合成”的種種陰謀論

自疫情爆發(fā)以來(lái)，有關(guān)新冠病毒是“人工合成”的論調(diào)層出不窮。

最早有人扒出曾與2015年發(fā)表在Nature上的一篇論文，并以此為據(jù)，稱(chēng)新冠病毒是人為制造的。

那么這個(gè)論文的內(nèi)容是什么呢？

其實(shí)該論文闡述的是研究人員用SARS-CoV反向遺傳系統(tǒng)，生成并鑒定了一種類(lèi)似SARS新型冠狀嵌合病毒。

在體內(nèi)實(shí)驗(yàn)中證明，嵌合病毒在小鼠肺中的復(fù)制具有明顯的發(fā)病機(jī)理，能夠感染小鼠呼吸道細(xì)胞并引發(fā)嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合征。這項(xiàng)研究可以表明，蝙蝠種群中流行的病毒，可能會(huì)再次導(dǎo)致像SARS那樣的傳播風(fēng)險(xiǎn)。

該研究由美國(guó)北卡羅萊納大學(xué)教堂分校主導(dǎo)，石正麗是該論文的作者之一，而她現(xiàn)在擔(dān)任中科院武漢病毒所研究員，于是這一巧合之下，不少陰謀論開(kāi)始滋生。

“疫情源頭是實(shí)驗(yàn)室病毒泄露”、“病毒是美國(guó)人制造的”等傳言，流傳于網(wǎng)絡(luò)上，這篇論文成為了這類(lèi)謠言的論據(jù)。

與此同時(shí)，不甘寂寞的印度也搞出了一個(gè)“大新聞”。

印度德里大學(xué)和印度理工學(xué)院的研究人員在bioRxiv的預(yù)印本上發(fā)表了一篇論文稱(chēng)：“在新冠病毒突刺蛋白中發(fā)現(xiàn)4個(gè)插入序列，其與HIV-1gp120和Gag高度相似，而這4個(gè)插入序列均為新冠病毒獨(dú)有，在其他冠狀病毒中不存在。”

該論文將新冠病毒與引發(fā)“非典”疫情的類(lèi)似冠狀病毒的基因組進(jìn)行了對(duì)比，分析了二者存在差異的地方，然而發(fā)現(xiàn)了與艾滋病毒的關(guān)聯(lián)。論文摘要中寫(xiě)道：4個(gè)獨(dú)特的插入序列都與HIV-1關(guān)鍵結(jié)構(gòu)蛋白中的氨基酸殘基具有同一性，這在自然界中不太可能是偶然的。

需要強(qiáng)調(diào)的是：bioRxiv網(wǎng)站不是學(xué)術(shù)期刊，在這上面刊登的論文，無(wú)需經(jīng)過(guò)同行審閱，可由學(xué)者自行刊發(fā)。

這篇論文發(fā)表后遭到了學(xué)術(shù)界強(qiáng)烈質(zhì)疑。

美國(guó)弗雷德·哈欽森癌癥研究中心研究員、全球聯(lián)合分析新冠病毒基因組項(xiàng)目的領(lǐng)導(dǎo)者之一的特雷弗·貝德福德就表示，“該論文不該發(fā)表�！币�?yàn)閺男鹿诓《镜幕�因上�?lái)看，根本沒(méi)有基因工程的證據(jù)，病毒變異完全符合自然進(jìn)化規(guī)律。

貝德福德還指出，該論文得出的結(jié)論在很多層面上都是錯(cuò)誤的，所謂的4個(gè)插入序列并不是獨(dú)一無(wú)二的，它們也不是插入的，而是天然的。

最終這篇未經(jīng)審稿的論文以撤稿結(jié)束。

如今在Andersen的這篇論文發(fā)布后，眾多國(guó)際著名病毒學(xué)家紛紛轉(zhuǎn)載這篇文章并支持駁斥了新冠病毒人工合成陰謀論。在科學(xué)的強(qiáng)有力證明下，一些在社交媒體上推崇新冠病毒人工合成論的人被瘋狂“打臉”后，刪除了他們的陰謀論。