今天螺螄粉和大家分享的是10+學(xué)習(xí)筆記。

題目:非裔美國(guó)人前列腺切除術(shù)后前列腺基質(zhì)復(fù)發(fā)的計(jì)算機(jī)衍生基質(zhì)特征的圖像signature

一． 研究背景

數(shù)據(jù)顯示,在前列腺癌根治術(shù)后,有30%-40%的前列腺癌患者出現(xiàn)復(fù)發(fā)。盡管有證據(jù)表明在非裔美國(guó)人(AA)患者中存在獨(dú)特的,更具侵略性的前列腺癌表型,但是現(xiàn)有的用于復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè)的臨床模型并未考慮到腫瘤表型基于特定人群的變異。因此作者研究了腫瘤內(nèi)基質(zhì)數(shù)字化測(cè)量、人群特異表型,創(chuàng)建改進(jìn)的模型來(lái)預(yù)測(cè)根治性前列腺切除術(shù)后的復(fù)發(fā)的能力。

二． 分析流程

三． 結(jié)果解讀

1． 患者數(shù)據(jù)集的臨床病理特征。

表1提供了患者數(shù)據(jù)集的臨床和病理特征�？偣�334例接受了前列腺癌根治術(shù)的前列腺癌患者被確定包括在本研究中。BCR(生化復(fù)發(fā))的平均時(shí)間約為3年,最后一次隨訪的平均時(shí)間約為5年。全部隊(duì)列的患者手術(shù)時(shí)大約60歲。通過(guò)Wilcoxon秩和檢驗(yàn)沒(méi)有發(fā)現(xiàn)測(cè)試集和驗(yàn)證集中臨床或人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征的分布差異。

表1:全數(shù)據(jù)集的臨床病理特征摘要

補(bǔ)充圖S2中提供了CONSORT式流程圖,描述了患者信息的處理流程:在三個(gè)不同的機(jī)構(gòu)進(jìn)行手術(shù)程序和樣品制備,每個(gè)樣本都經(jīng)過(guò)泌尿生殖系統(tǒng)的病理檢查,用數(shù)字標(biāo)注了代表性的癌變區(qū)域,用于本研究的定量組織形態(tài)學(xué)檢查(圖1A)。

使用先前基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)開發(fā)的深度學(xué)習(xí)方法對(duì)核核基質(zhì)進(jìn)行分割(圖1B)。其模式是輸出置信度圖,圖像中每一個(gè)像素點(diǎn)是基質(zhì)中核的一部分的可能性(圖1C和D)。對(duì)這些概率圖進(jìn)行閾值處理,并用于計(jì)算基質(zhì)圖像特征(圖1E和F)。基質(zhì)形態(tài)描述符用于訓(xùn)練預(yù)后模型(圖1G),該模型可預(yù)測(cè)BCR風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分(圖1H)。

圖1:數(shù)據(jù)集準(zhǔn)備,分析和預(yù)后模型的構(gòu)建。