從優(yōu)秀案例中學(xué)習(xí)CAR的結(jié)構(gòu)設(shè)計
近期,National Cancer Institute (NCI)和Kite等聯(lián)合發(fā)文-《Safety and feasibility of anti-CD19 CAR T cells with fullyhuman binding domains in patients with B-cell lymphoma》,介紹了新的CAR結(jié)構(gòu)設(shè)計的全人源化的抗CD19 CAR-T細胞的I期臨床試驗(NCT02659943)。
圖1 Hu19-CD828z和FMC63-28z的CAR結(jié)構(gòu)設(shè)計圖
具體CAR設(shè)計如圖1所示,其中Hu19-CD828z是新設(shè)計,F(xiàn)MC63-28z是已上市的Yascarta的結(jié)構(gòu)。這個試驗結(jié)果顯示,Hu19-CD828Z T細胞具有與表達FMC63-28Z的T細胞相似的臨床抗淋巴瘤活性,55%患者獲得了完全緩解。
然而,接受Hu19-CD828Z T細胞的患者中只有5%發(fā)生嚴重的神經(jīng)系統(tǒng)毒性,而接受 FMC63-28Z T細胞的患者中有50%經(jīng)歷了這種程度的毒性(P=0.0017)。在接受Hu19-CD828Z T細胞的患者的血液中檢測到的細胞因子水平低于接受FMC63-28Z T細胞的患者的血液,這可以解釋與Hu19-CD828Z相關(guān)的較低水平的神經(jīng)毒性。表達CAR的T細胞釋放的細胞因子水平特別取決于CAR設(shè)計中包含的鉸鏈和跨膜結(jié)構(gòu)域。
由此案例出發(fā),本文計劃探討工程化CAR的細胞外、間隔區(qū)、跨膜和細胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域的最新進展,以及它們?nèi)绾斡绊慍AR-T功能。這種系統(tǒng)分析可以幫助揭示設(shè)計原則,這些原則可以廣泛應(yīng)用于未來的設(shè)計者免疫療法。
1
CAR的基本結(jié)構(gòu)介紹
圖2 嵌合抗原受體結(jié)構(gòu)概述
CAR結(jié)構(gòu)包括三個主要部分胞外結(jié)合域、跨膜結(jié)構(gòu)域和胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域。胞外結(jié)構(gòu)域由抗原結(jié)合域(通常是單鏈可變片段scfv)和鉸鏈區(qū)構(gòu)成。胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域包括共刺激結(jié)構(gòu)域和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)構(gòu)域構(gòu)成。
以下分為胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域和胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域三部分來介紹。
2
胞外結(jié)構(gòu)域
2.1
抗原結(jié)合域介紹
CAR胞外域設(shè)計的標準方法基于單克隆抗體,其可變區(qū)連接成單鏈可變片段或scFv(圖3)。另一種在臨床上用的方法是利用天然存在的受體-配體對。還有一種具有巨大潛力的相關(guān)方法是使用駱駝單域抗體片段,其特點是缺乏輕鏈,這種“納米抗體”顯示出有效的體內(nèi)腫瘤靶向性,并且沒有免疫原性。
圖3 嵌合抗原受體 (CAR)-T 細胞的胞外結(jié)構(gòu)域
scFv的四個重要特征是免疫原性、親和力、特異性及其結(jié)合表位。
從鼠雜交瘤中獲得的單克隆抗體 (mAb) 被發(fā)現(xiàn)在人類中具有免疫原性,導(dǎo)致低效力和立即從循環(huán)中消除,還表現(xiàn)出全身炎癥反應(yīng),導(dǎo)致嚴重的生理并發(fā)癥。因此,scFv的人源化有助于提高CAR的安全性和治療潛力。
親和力是一個關(guān)鍵參數(shù),它解釋了多種受體-配體相互作用,并受CAR表達水平、靶細胞上的配體密度和單個配體結(jié)合域的親和力影響。親和力已被調(diào)節(jié)以提CAR的特異性并減少“在靶點、腫瘤外”副作用,當(dāng)靶標抗原在健康組織上普遍表達時,這一點尤其重要。親和力調(diào)節(jié)可以影響CAR信號傳導(dǎo)和其他效應(yīng)器功能,如細胞因子分泌、增殖和持久性。
腫瘤相關(guān)抗原(TAA)是免疫治療的主要靶點,在腫瘤組織中高度表達,在健康組織中也以較低水平表達。這會導(dǎo)致不必要的識別,有時還會導(dǎo)致危及生命的毒性。因此,在設(shè)計 CAR 以區(qū)分腫瘤細胞和正常組織時,scFv 選擇至關(guān)重要。為避免這些并發(fā)癥,應(yīng)仔細了解 CAR scFv 與靶抗原之間的相互作用,并應(yīng)在最終確定 scFv 之前進行交叉反應(yīng)性研究。
目標表位的結(jié)構(gòu)、空間可用性和功能方面也需要包括在CAR的設(shè)計考慮中。新的CAR設(shè)計,例如利用串聯(lián)連接的scFv序列靶向兩個抗原的雙特異性CAR,可能需要額外的設(shè)計工作來確定合適的CAR結(jié)構(gòu),從而允許訪問兩個目標。
文獻報道低親和力的CD19 CAR與傳統(tǒng)的基于FMC63的CAR相比,低親和力抗CD19 CAR (CAT-CAR)顯示出增加的抗原特異性增殖和增加的體內(nèi)持久性,即使發(fā)現(xiàn)兩者都靶向 CD19 抗原上的相似表位。兩種CAR的IL-2和IFNγ分泌水平相當(dāng),而TNFα 在低親和力 CAT-CAR(體外和體內(nèi)的情況下略有增加)。
圖4 FMC63 CAR 和CAT-CAR的親和力差異
因此,scFv 的這四個方面(免疫原性、特異性、親和力、目標定位)對于確定 CAR T 細胞的安全性和功能功效至關(guān)重要。
2.2
鉸鏈區(qū)介紹
鉸鏈/間隔區(qū)區(qū)域由CAR的非抗原結(jié)合細胞外區(qū)域組成。將scFv連接到跨膜域的間隔域為scFv提供了靈活性并有助于提高功效。已經(jīng)觀察到,鉸鏈/間隔區(qū)通過提供柔韌性,延長長度,允許二聚化或改善穩(wěn)定性來調(diào)節(jié)CAR功能。已經(jīng)提出這些性質(zhì)影響效應(yīng)細胞-靶細胞相互作用,從而影響活化信號強度。
常見的鉸鏈/間隔區(qū)已利用免疫球蛋白Fc,CD8a和CD28間隔區(qū)。當(dāng)使用來自IgG1或IgG4的鉸鏈-CH2-CH3間隔區(qū)構(gòu)建CAR時,它們表現(xiàn)出與Fc γ受體的結(jié)合。這通過加速衰老、激活誘導(dǎo)細胞死亡等對持久性和活性產(chǎn)生負面影響,但CH2結(jié)構(gòu)域的突變或缺失減輕了這些影響。
開頭介紹的文章中作者同一個CAR將CD28鉸鏈區(qū)換成CD8鉸鏈區(qū),就影響了神經(jīng)毒性。
Almasbak等考察了沒有鉸鏈域的CAR-T細胞能否增強腫瘤殺傷是一個問題。因此,設(shè)計了兩種有或沒有鉸鏈域的CAR來研究這個問題。最后,結(jié)論是鉸鏈可以增強某些特定CAR-T細胞的擴增和抗腫瘤功效。因此,在設(shè)計CAR時應(yīng)考慮抗原靶點位置和鉸鏈長度,這對CAR-T細胞的活性至關(guān)重要。
圖5 體內(nèi)缺乏抗白血病活性與 IgG1-Fc 間隔區(qū)有關(guān)
為了保持最佳突觸距離,膜遠端表位通常需要較短的間隔區(qū),而膜近端表位需要較長的間隔區(qū)。改變間隔長度會對CAR-T細胞的細胞溶解活性和信號傳導(dǎo)產(chǎn)生深遠的影響。
3
跨膜結(jié)構(gòu)域介紹
CAR結(jié)構(gòu)中的跨膜結(jié)構(gòu)域作為將配體識別信號轉(zhuǎn)導(dǎo)至細胞內(nèi)胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域的支點。多年來,CAR跨膜結(jié)構(gòu)域的相關(guān)性在很大程度上被忽略了,因為這種結(jié)構(gòu)成分被認為仍然是受體的惰性部分。跨膜區(qū)具有為CAR受體提供穩(wěn)定性的能力,有助于與可能影響CAR T細胞功能的其他細胞表面蛋白締合。鉸鏈/間隔物設(shè)計的重要性差異很大,可能需要根據(jù)目標表位的相對位置逐案確定靈活性和距離要求。
為了闡明鉸鏈和跨膜結(jié)構(gòu)域在CAR 和 CAR-T 細胞功能中的作用,生成了不同的嵌合體并分析了它們在CAR-T細胞上的表達水平和抗原特異性活性。首先,創(chuàng)建了一個具有鉸鏈、跨膜和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)域源自 CD3ζ,然后生成了六個 CAR 變體,其鉸鏈或鉸鏈/跨膜域源自CD4、CD8α和CD28。T細胞上的CAR表達水平和穩(wěn)定性受跨膜而非鉸鏈結(jié)構(gòu)域的影響很大。大多數(shù)CAR-T細胞的抗原特異性功能取決于它們的CAR表達水平。
然而,盡管表達水平相同,但具有CD8α 或CD28衍生鉸鏈域的CAR在CAR-T細胞功能方面表現(xiàn)出顯著差異。這些結(jié)果表明[7],進入T細胞的CAR信號強度不僅受CAR表達水平的影響,還受鉸鏈結(jié)構(gòu)域的影響,鉸鏈域調(diào)節(jié)CAR信號閾值,跨膜域通過控制CAR表達水平來調(diào)節(jié)CAR 信號量。
圖6. 帶有鉸鏈域 (HD)或鉸鏈/跨膜域 (HD/TMD) 修飾的血管內(nèi)皮生長因子受體 2 (VEGFR2) 特異性嵌合抗原受體 (CAR) 的圖示。
跨膜介導(dǎo)的相互作用也可用于產(chǎn)生新的CAR設(shè)計,例如可以傳遞跨細胞質(zhì)域信號的拆分CAR系統(tǒng)。
圖7. 跨膜域相互作用可以提供新穎的CAR設(shè)計[2]
4
胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域
胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域包括共刺激結(jié)構(gòu)域和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)構(gòu)域構(gòu)成。
4.1
CAR的不同代次
根據(jù)胞內(nèi)共刺激域的差異,將CAR分為四個不同的代次。
圖8 設(shè)計嵌合抗原受體 (CAR)-T 細胞:CAR 蛋白利用抗體的抗原識別能力
最基本的CAR設(shè)計,稱為第一代CAR,包含一個抗原結(jié)合域,該域直接融合到TCR不變鏈CD3ζ的細胞內(nèi)部分。第一代CAR通過磷酸化CD3ζ中基于免疫受體酪氨酸的激活基序 (ITAM) 域來啟動激活級聯(lián)反應(yīng)。該信號不足以激活T細胞,需要外源性給予細胞因子。因此,最初的臨床試驗產(chǎn)生了令人失望的結(jié)果。
第二代CAR-T細胞將來自其他受體(如CD28、4-1BB (CD137))的共刺激結(jié)構(gòu)域整合到CAR的細胞內(nèi)片段中,以提高激活、增殖和存活率。這一概念在一項優(yōu)雅的臨床研究中得到了證明,將CD28作為共刺激摻入CD19 CAR-T細胞導(dǎo)致細胞擴增和存活率增加 [15]。
第三代CAR-T細胞結(jié)合了幾個信號域,期望能增強 T 細胞的活化、增殖和存活。然而,在實踐中,這種方法提供的臨床益處仍在討論中。
最近提出了第四代CAR-T細胞,因為它引入了一個細胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域,能夠觸發(fā)由細胞因子誘導(dǎo)的信號(信號3)。
考慮到最終控制抗腫瘤功效的變量的多樣性,每個特定共刺激信號的貢獻對于每種腫瘤類型、胞外域和/或靶抗原是不同的。需要在CAR背景下對共刺激的分子免疫生物學(xué)進行系統(tǒng)的重新評估,以解決這些系統(tǒng)的復(fù)雜性,并為合理設(shè)計下一代CAR-T細胞制定指導(dǎo)方針。
4.2
共刺激結(jié)構(gòu)域介紹
最常見的共刺激域是CD28和4-1BB。CD28共刺激提供更強烈的急性反應(yīng)和有限的長期持久性的一般趨勢,而4-1BB共刺激則相反。
已經(jīng)研究了許多共刺激分子,包括CD28、4-1BB (CD137)、CD27、OX40 (CD134) 和 ICOS,它們已被納入CAR的設(shè)計在臨床中以進一步驗證治療效果。
多種共刺激結(jié)構(gòu)域及其組合已在體外和體內(nèi)進行了測試,但對于CAR-T細胞的理想設(shè)計尚未達成共識。共刺激域的選擇可能取決于臨床適應(yīng)癥以及其他 CAR模塊。
Guedan及其同事探索了4-1BB、ICOS和CD3ζ的多種細胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域組合,發(fā)現(xiàn)表達具有ICOS-4-1BB-CD3ζ細胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域和ICOS跨膜結(jié)構(gòu)域的CAR 的T細胞導(dǎo)致體內(nèi)擴增和持久性增強35天內(nèi)腫瘤消退100%。值得注意的是,具有ICOS–4–1BB–CD3ζ 但使用CD8跨膜結(jié)構(gòu)域的CAR僅顯示適度的腫瘤消退。鑒于這種CD8修飾的CAR也表達較低水平的IL-13和IL-6,作者認為細胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域的近膜部分在確定CAR-T細胞的細胞因子譜中具有重要作用。
圖9 包含與間皮素結(jié)合并在跨膜和細胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域不同的 SS1 單鏈片段的嵌合受體的示意圖
圖10 ICOSBBz增強的體內(nèi)功能僅在ICOS靠近細胞膜時觀察到
4.3
信號轉(zhuǎn)導(dǎo)結(jié)構(gòu)域
ITAM是造血細胞受體胞質(zhì)域中的序列基序。T細胞和傳統(tǒng)CAR-T細胞在參與信號傳導(dǎo)的ITAM數(shù)量方面存在主要差異。將ITAM的數(shù)量從三個減少到兩個,可以選擇性識別表達高目標密度的細胞。
馬茲納等人還表明,在基于4-1BB 的第二代CAR中,CD3ζ ITAMs 從3個增加到 6 個增加了T細胞增殖、IL-2 產(chǎn)生以及體內(nèi)抗腫瘤反應(yīng)。在另一項研究中,CD3ζ 的每個ITAM 都發(fā)生了突變,發(fā)現(xiàn)功能性ITAM的數(shù)量及其位置都會影響CAR-T細胞增殖、體內(nèi)腫瘤根除以及分化表型。在同一項研究中,作者表明單個膜近端功能性ITAM與CD28細胞質(zhì)結(jié)構(gòu)域結(jié)合能夠維持增殖、持久性和細胞毒性。
圖11 野生型和突變型1928ζ CAR 的細胞質(zhì)區(qū)域。
在CAR-T細胞中,受ITAM影響的信號機制尚不清楚。特別是,反式ITAM的可用性增強了 T 細胞中不同的信號機制。ITAM的這些方面對CAR設(shè)計有影響,對信號這些方面的更好理解可以極大地為 CAR-T 設(shè)計提供信息。
結(jié)論和挑戰(zhàn)
CAR 結(jié)構(gòu)的每個模塊都獨立和協(xié)同地影響 CAR 功能。
降低 scFv 的親和力已被證明可以提高對腫瘤的選擇性識別,從而降低對靶點和腫瘤外的毒性。然而,降低親和力也會導(dǎo)致活化和抗腫瘤細胞毒性降低。選擇正確的細胞質(zhì)域可以增強這些信號。間隔區(qū)的長度和性質(zhì)會影響免疫突觸距離,并且對于確定細胞溶解至關(guān)重要。
與scFv 結(jié)合使用時,間隔區(qū)對于實現(xiàn)目標表位的可及性至關(guān)重要。跨膜結(jié)構(gòu)域是關(guān)鍵的結(jié)構(gòu)成分,有可能被用于具有共刺激結(jié)構(gòu)域和 CD3ζ 結(jié)構(gòu)域反式耦合的新型 CAR 系統(tǒng)。在這篇綜述中,我們專注于討論 CAR 分子本身的設(shè)計,但必須承認CAR蛋白以外的參數(shù)會顯著影響CAR-T細胞功能也很重要。例如,轉(zhuǎn)導(dǎo)載體系統(tǒng)的選擇和CAR的插入位點對療效有深遠的影響。
許多研究采用合理的蛋白質(zhì)設(shè)計和/或文庫篩選來優(yōu)化CAR序列。CAR組件可以根據(jù)其體外和體內(nèi)功能以組合或順序方式進行修飾。在一項研究中,使用兩個不同的scFv序列靶向CD19和CD20的雙特異性CAR依次確定了間隔區(qū)和 scFv接頭要求,以實現(xiàn)對兩種抗原的最佳靶向。
CAR-T 開發(fā)的第二個主要障礙是確定與體內(nèi)功效相關(guān)的體外定量參數(shù)。已經(jīng)表明,諸如體外活化和細胞因子釋放等參數(shù)并不總是與所需的體內(nèi)結(jié)果相關(guān)。最終,需要開發(fā)和驗證用于CAR-T設(shè)計的體外功能分析,并與動物模型和臨床數(shù)據(jù)的體內(nèi)結(jié)果相關(guān)聯(lián)。
沿著這條線,多功能性,即 T 細胞產(chǎn)生不止一種類型的細胞因子的能力,作為與體內(nèi)功效相關(guān)的體外測量方法已經(jīng)受到關(guān)注。使用一種新型的基于單細胞的測定法測試了輸注前抗CD19 CAR-T 產(chǎn)品的32種不同細胞因子和趨化因子,據(jù)報道,增加的多功能性與改善的患者反應(yīng)相關(guān)?梢远吭儐栴A(yù)測體內(nèi) CAR-T 細胞功能的參數(shù)的功能分析平臺將極大地促進相關(guān) CAR 設(shè)計原理的闡明,能夠更好地理解CAR-T細胞生物學(xué),并促進 CAR 格式的發(fā)現(xiàn)新功能。
最終,這些努力可以簡化免疫療法的發(fā)現(xiàn)過程,從而以更低的成本和更短的開發(fā)時間獲得有效的CAR-T候選藥物。
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